در چه سیستم عاملی؟ اگر در ویندوز ویستا هستید، Regional and Language Options> Administrative> System Locale رو فارسی کنید.
یا هم اگر فایلتون زیرنویس متنی هست،معمولا پسوند .srt) با نوت پد بازش کنید و ببینید تکست انکودینگش چیه، اگر UTF-8 نبود به همین گزینه تغییرش بدید.